Der Physikunterricht an der Ernst-Reuter-Schule II beginnt in der 7. Jahrgangsstufe und wird durchgängig bis in die 10. Jahrgangsstufe unterrichtet. Dabei verteilt sich der Unterricht in den verschiedenen Jahrgangsstufen wie folgt:
| Jahrgang 7 | 2 Wochenstunden | Thermodynamik (Wärmelehre), Optik |
| Jahrgang 8 | 2 Wochenstunden | Elektrizitätslehre |
| Jahrgang 9 | 1 Wochenstunde | Mobilität und Bewegung, Kräfte und ihre Wirkungen |
| Jahrgang 10 | 2 Wochenstunden | Energie in Umwelt und Technik |
Dabei wird darauf geachtet, die unterschiedlichen Themen möglichst alltagsorientiert zu vermitteln. Ein Schwerpunkt des Unterrichts besteht darin, die Theorie mit den damit zusammen-hängenden Schüler-Experimenten durchzunehmen. In dieser Hinsicht ist der Fachbereich Physik weitgehend so ausgerüstet, dass die Schülerinnen und Schüler in 3er bis 4er-Gruppen experimentieren können. Damit diese Form des naturwissenschaftlichen Unterrichts möglichst effizient angewendet werden kann, werden in der Jahrgangsstufe 9 zwei Klassen (in der Regel die Parallelklassen) in drei Gruppen aufgeteilt. Somit bestehen die Kurse aus maximal 18 Schülerinnen und Schülern, was ein effektives und gut betreutes Experimentieren erlaubt.
Der Fachbereich Physik verfügt über zwei reine Physikräume, wobei einer davon mit einem Smartboard ausgerüstet ist. Ein dritter Raum wird gemeinsam mit dem Fachbereich Biologie verwendet.
In den Jahrgangstufen 9 und 10 wird der Unterricht in Erweiterungs- (E-) und Grund- (G)-Kursen erteilt, wobei die verschiedenen Gruppen gemischt werden (binnendifferenzierter Unterricht).